Ο Ηρόδοτος δίνει δύο συγκεκριμένους λόγους για την επιλογή του Μαραθώνα: το πεδίο ευνοούσε το ιππικό και βρισκόταν κοντά στην ήδη κατακτημένη Ερέτρια. Καθοριστικός ήταν και ο ρόλος του εξόριστου Ιππία.
Ο Ηρόδοτος γράφει ότι οι Πλαταιείς έφτασαν στον Μαραθώνα «πανδημεί», σε πλήρη κινητοποίηση. Γιατί μια μικρή βοιωτική πόλη στάθηκε στο πλευρό της Αθήνας απέναντι στους Πέρσες;